Galería de Rectores
Período Pre- Autónomo
- Presbítero José Trinidad Reyes 18 de septiembre 1847
- Doctor Hipólito Casiano Matute Septiembre 1855 – 1865
- Abogado Trinidad Ferrari Agüero 1865 – 1867
- Abogado Jerónimo Zelaya 1867
- Abogado Valentín Durón 1868 – 1873
- Presbítero Yanuario Girón Bustillo abril 1873
- Abogado Valentín Durón 1874
- Presbìtero Yanuario Girón Bustillo noviembre 1874 – 1882
- Abogado Adolfo Zùniga Midence 26 de febrero 1882 – 1883
- Doctor Esteban Ferrari 11 de junio 1883 - 1888
- Doctor Antonio Abad Ramírez Fontecha 5 de enero 1888 – 1892
- Abogado Rafael Alvarado Manzano 21 de enero 1892 – 1900
- Abogado José Leonard 16 de febrero 1900 – 1901
- Abogado Rafael Alvarado Manzano 01 de octubre 1901 – 1903
- Abogado Pedro José Bustillo 26 de mayo 1903 – 1907
- Abogado Carlos Alberto Uclès Soto 24 de abril 1907 – 1908
- Abogado Rómulo Ernesto Durón Gamero 26 de mayo 1908 – 1911
- Abogado Alberto A. Rodríguez 18 de octubre 1911
- Abogado Rómulo Ernesto Durón 20 de noviembre 1911 – 1915
- Abogado Carlos Alberto Cuclès Soto 07 de agosto 1915
- Abogado Rafael Alvarado Manzano 24 de noviembre 1916 – 1916
- Abogado Carlos Alberto Uclès Soto 03 de mayo 1916
- Abogado Leandro Valladares Gálvez 1917 – 1920
- Abogado Carlos Alberto Uclès Soto 1920
- Abogado José María Sandoval Burgos 1920 – 1933
- Abogado Ramón Alcerro Castro 20 de mayo 1933 – 1936
- Abogado Timoteo Chirinos Zuniga 01 de agosto 1936 – 1947
- Abogado Tomas Alonzo Brito 19 de junio 1947 – 1949
- Doctor Carlos Maximiliano Gálvez Rovelo 14 de febrero 1949
- Abogado Ramón Ernesto Cruz Ucles 18 de febrero 1949
- Licenciado Jorge Fidel Durón Durón 14 de mayo 1949 – 1955
- Doctor Ernesto Argueta Ayes 20 de enero 1955 – 1956
Período Autónomo
- Doctor Lisandro Gálvez Flores 14 de octubre 1956 – 1960
- Doctor Hernán Corrales Padilla 19 de mayo 1960 – 1963
- Ingeniero Arturo Quesada Galindo 01 de agosto 1963 – 1969
- Licenciado Cecilio Zelaya Lozano 03 de agosto 1969 – 1973
- Doctor José Reina Valenzuela 08 de junio 1973
- Licenciado Jorge Arturo Reina 29 de junio 1973 – 1979
- Doctor Juan Almendraros Bonilla 02 de julio 1979 – 1982
- Abogado José Oswaldo Ramos Soto 04 de julio 1982 – 1988
- Licenciado Jorge Omar Casco 06 de junio 1988 – 1991
- Doctor René Sagastume Castillo 07 de junio 1991 – 1997
- Doctora Ana Belén Castillo de Rodríguez 07 de junio 1997 – 2003
- Doctor Raúl Antonio Santos M. (Interino) 08 de junio 2003
- Abogado Guillermo Pérez Cadalso 30 de junio 2003 – 2006
- Doctor Raúl Antonio Santos M. 28 de marzo 2006 – 2008
- Doctor Jorge Abrahán Arita León 18 de mayo 2008
- Doctora Rutilia Calderon (Interina) 19 de diciembre 2008 – 2009
- Licenciada Julieta Castellanos 24 de abril 2009 - 2013
- Doctor Francisco J. Herrera Alvarado 26 de septiembre 2017- a la fecha