Galería de Rectores
Período Pre- Autónomo
| 1 | Presbítero José Trinidad Reyes | 18 de septiembre 1847 |
| 2 | Doctor Hipólito Casiano Matute | 1855 – 1865 |
| 3 | Abogado Trinidad Ferrari Agüero | 1865 – 1867 |
| 4 | Abogado Jerónimo Zelaya | 1865 – 1867 |
| 5 | Abogado Valentín Durón | 1868 – 1873 |
| 6 | Presbítero Yanuario Girón Bustillo | 1873 |
| 7 | Abogado Valentín Durón | 1874 |
| 8 | Presbìtero Yanuario Girón Bustillo | 1874 – 1882 |
| 9 | Abogado Adolfo Zúniga Midence | 1882 – 1883 |
| 10 | Doctor Esteban Ferrari | 1883 - 1888 |
| 11 | Doctor Antonio Abad Ramírez Fontecha | 1888 – 1892 |
| 12 | Abogado Rafael Alvarado Manzano | 1892 – 1900 |
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13 |
Abogado José Leonard | 1900 – 1901 |
| 14 | Abogado Rafael Alvarado Manzano | 1901 – 1903 |
| 15 | Abogado Pedro José Bustillo | 1903 – 1907 |
| 16 | Abogado Carlos Alberto Uclés Soto | 1907 – 1908 |
| 17 | Abogado Rómulo Ernesto Durón Gamero | 1908 – 1911 |
| 18 | Abogado Alberto A. Rodríguez | 1911 |
| 19 | Abogado Rómulo Ernesto Durón | 1911 – 1915 |
| 20 | Abogado Carlos Alberto Uclés Soto | 1915 |
| 21 | Abogado Rafael Alvarado Manzano | 1916 |
| 22 | Abogado Carlos Alberto Uclés Soto | 1916 |
| 23 | Abogado Leandro Valladares Gálvez | 1917 – 1920 |
| 24 | Abogado Carlos Alberto Uclés Soto | 1920 |
| 25 | Abogado José María Sandoval Burgos | 1920 – 1933 |
| 26 | Abogado Ramón Alcerro Castro | 1933 – 1936 |
| 27 | Abogado Timoteo Chirinos Zúniga | 1936 – 1947 |
| 28 | Abogado Tomas Alonzo Brito | 1947 – 1949 |
| 29 | Doctor Carlos Maximiliano Gálvez Rovelo | 1949 |
| 30 | Abogado Ramón Ernesto Cruz Uclés | 1949 |
| 31 | Licenciado Jorge Fidel Durón Durón | 1949 – 1955 |
| 32 | Doctor Ernesto Argueta Ayes | 1955 – 1956 |
Período Pre- Autónomo
| 1 | Doctor Lisandro Gálvez Flores | 14 de octubre 1956 – 1960 |
| 2 | Doctor Hernán Corrales Padilla | 19 de mayo 1960 – 1963 |
| 3 | Ingeniero Arturo Quesada Galindo | 01 de agosto 1963 – 1969 |
| 4 | Licenciado Cecilio Zelaya Lozano | 03 de agosto 1969 – 1973 |
| 5 | Doctor José Reina Valenzuela | 08 de junio 1973 |
| 6 | Licenciado Jorge Arturo Reina | 29 de junio 1973 – 1979 |
| 7 | Doctor Juan Almendares Bonilla | 02 de julio 1979 – 1982 |
| 8 | Abogado José Oswaldo Ramos Soto | 04 de julio 1982 – 1988 |
| 9 | Licenciado Jorge Omar Casco | 06 de junio 1988 – 1991 |
| 10 | Doctor René Sagastume Castillo | 07 de junio 1991 – 1997 |
| 11 | Doctora Ana Belén Castillo de Rodríguez | 07 de junio 1997 – 2003 |
| 12 | Doctor Raúl Antonio Santos M. (Interino) | 08 de junio 2003 |
| 13 | Abogado Guillermo Pérez Cadalso | 30 de junio 2003 – 2006 |
| 14 | Doctor Raúl Antonio Santos M | 28 de marzo 2006 – 2008 |
| 15 | Doctor Jorge Abrahán Arita León | 18 de mayo 2008 |
| 16 | Doctora Rutilia Calderon (Interina) | 19 de diciembre 2008 – 2009 |
| 17 | Licenciada Julieta Castellanos | 24 de abril 2009 - 2013 | 2013 - 2017 |
| 18 | Doctor Francisco J. Herrera Alvarado (Interina) | 26 de septiembre 2017- 8 de enero 2024 |
| 19 | Abogado Odir Aarón Fernández Flores | 09 de enero 2024 - 2028 |
